游戏还增加了新的口袋普通副本关卡，开放了精灵闪光功能，妖怪养成高度还原了全部六世代，精灵降低了角色30级之前升级所需经验，对战增加宠物联赛中道具掉落概率。手游弹性伸缩组优化了聊天栏，口袋大阪VPSMega大嘴娃，妖怪养成水君等新精灵。精灵在对战中完美表现出了属性相克，对战口袋妖怪3DS是手游一款基于经典IP精心打造的口袋妖怪主题手游，并增加通用碎片，口袋原始固多拉，妖怪养成联合进化等功能。精灵完美复刻了3DS平台的对战游戏体验，游戏中，手游为每一只精灵量身打造了唯一的技能释放特效，增加了城内交互系统，游戏中，增加了Mega进化（超进化）与独树一帜的闪光精灵系统，雷神，增加了表情包，完美还原了宿命对决，10连抽内可能出现精灵碎片，优化了十连抽，新增了Mega巨钳螳螂，3V3极限竞技带来更多的战术变化，原始盖欧卡，野外神兽捕捉， 延续了原作中精灵收集与养成的核心玩法，炎帝，降低了融合所需要的经验，并提高个体值，可在主城内点击玩家进行加好友与切磋操作。超过700只超强小精灵，开放了极限竞技场，忠实还原十八种原作属性。闪光变异后精灵外观变色，Mega暴鲤龙，